Clark rivela di aver ucciso i genitori di Sherry per aver scoperto il segreto dell'Infinito, usato da Yliaster per cambiare la storia. Manda Yusei, Sherry e Bruno in un wormhole, in cui sono destinati a rompersi e a crollare. Sherry usa la sua carta per riprendere il controllo della navetta, ma finisce per essere risucchiata. Yusei e Bruno entrano in una dimensione "deformata" nel futuro, e passano vicino ad una strana isola (una gigantesca, galleggiante, capovolta "fortezza metallica", la Culla dell'Arca), dove Yusei viene brevemente visitato di nuovo da suo padre, che lo avverte di una Ener-D che distruggerà l'umanità, prima di riportare lui e Bruno nel loro mondo natale (il Presente).
