Coulson i jego zespół są teraz poszukiwanymi uciekinierami, którzy dysponują ograniczonymi środkami – ale nie powstrzymuje ich to od zapewniania bezpieczeństwa światu w obliczu znajdujących się wszędzie potężnych i niewidocznych zagrożeń. Jednakże z nowymi członkami, których ledwie znają, czy będzie można znów zaufać T.A.R.C.Z.Y.?
