A bordo di una nave inglese della Royal Navy viene ritrovato il corpo senza vita di un guardimarina americano. Gibbs e la sua squadra vengono chiamati ad indagare, ma le complicazioni iniziano quando qualcuno cerca di arrivare alla nave prima dell'NCIS. Scoprono che il marine defunto era coinvolto nella consegna di una grande quantità di denaro della CIA, utilizzati per pagare i signori della guerra e dittatori in Afghanistan; tuttavia i soldi sono scomparsi. In un primo momento, il team sospetta che l'ufficiale di collegamento della Royal Navy sia il responsabile, ma presto scoprirà che in realtà è un agente MI6, incastrato per il furto. Con il suo aiuto, riusciranno a rintracciare il vero colpevole.