L'NCIS investiga sulla morte di un comandante di una nave militare, trovato morto nella sua stanza, apparentemente ucciso. Nel frattempo Gibbs e il suo team vengono valutati psicologicamente dalla dottoressa Rachel Cranston che in seguito si scoprirà essere la sorella maggiore dell'agente Kate Todd. Si scopre che il comandante si è suicidato, poiché era ormai vicino al pensionamento obbligatorio e non aveva altra vita all'infuori della Marina; così i suoi colleghi avevano mascherato il suicidio in segno di rispetto per lui.
