Det första avsnittet berättar historien om meteorregnet som träffar byn Smallville och förändrar livet i Kansas-byn för alltid. Clark Kent upptäcker att han är en utomjording och träffar för första gången Lex Luthor och en rad människor som blivit mutanter av de gröna stenarna som föll ner i Smallville tillsammans med Clark Kent.
