일식이 있던 날, 한 실험실에서 미나미 코타로와 아키즈키 노부히코 두 소년의 몸에 신성한 돌이 이식된다. 그 후 수십 년이 흐르고 세상은 두 진영으로 나뉜다. 괴인을 사회 밖으로 내쫓으려는 사람들과 괴인과의 공존을 꿈꾸는 사람들로 나뉜 것이다. 그 혼돈 속에 홀로 은둔자로 살아가는 미나미 코타로라는 남자가 있다. 한편 아오이 이즈미라는 소녀는 차별 종식을 호소하고 분열된 세상을 변화하기 위해 UN 강단에서 연설한다.그리고 소녀와 코타로가 만나며 멈췄던 시간이 다시 흐르기 시작하는데…
