Shun Hanamori et Kôjirô Shindô, deux employés du ministère des Affaires étrangères japonais, s’apprêtent à décoller lorsqu’un immense et mystérieux cube apparaît dans le ciel et vient absorber leur avion avant de s’immobiliser. Les autorités, qui n’ont jamais été confrontées à un tel phénomène, tentent d’élaborer un plan pour secourir les passagers.
