De twaalfjarige Gon Freecss ontdekt op een dag dat de vader waarvan hem altijd was verteld dat hij dood was, nog leeft. Zijn vader, Ging, is een jager – een lid van de elite van de samenleving met een vergunning om overal heen te gaan of bijna alles te doen. Gon, vastbesloten om in de voetsporen van zijn vader te treden, besluit het Hunter-examen af te leggen en uiteindelijk zijn vader te vinden . Maar onderweg leert hij dat er meer komt kijken bij het worden van een jager dan eerder werd gedacht, en dat de uitdagingen waarmee hij te maken krijgt, als de zwaarste ter wereld worden beschouwd.