Al termine di numerose ed estenuanti prove a cui è stato sottoposto dalle cinque sacerdotesse Midi-Chlorian, Yoda viaggia verso il mondo dei Sith, l'antica dimora di Moraband, dove deve affrontare un male antico. L'ultima sfida che Yoda affronterà è scegliere tra l'altruismo unito al sacrificio e il desiderio ingannevole di vendetta, sfida per la quale Darth Sidious e il Conte Dooku su Coruscant creano un diversivo nella Forza nella speranza di distruggere Yoda e l'Ordine dei Jedi; nella sfida Yoda si ritrova ad affrontare Sidious e Dooku insieme ad Anakin, che decapita Dooku e viene tramortito dai fulmini della Forza di Sidious, Yoda si sacrifica salvando la vita ad Anakin e allo stesso tempo rimane determinato ad affrontare Sidious, insieme precipitano nel vuoto, di Sidious ne rimane soltanto la tunica, segno che Yoda ha brillantemente superato la prova. Yoda e R2-D2 ritornano su Coruscant, ma il Jedi decide di tenere parzialmente nascosto ciò che ha appreso.
