Junko domine Juzo et en déduit qu'il est amoureux de Kyosuke, menaçant d'exposer ses sentiments à moins qu'il ne trahisse Kyosuke en déclarant qu'elle est innocente. Pendant ce temps, Chisa, qui a subi un lavage de cerveau par la vidéo de désespoir de Junko, envoie Chiaki dans une pièce souterraine où elle est capturée par Junko. Décidant que Chiaki est le dernier élément nécessaire pour terminer son prototype, Junko la force à passer par un donjon rempli de pièges mortels, tandis que le reste de la classe est forcé de la regarder se débattre en vain et est finalement mortellement blessée par des piques. Le désespoir qui en résulte, combiné aux méthodes de lavage de cerveau de Junko, déforme les élèves et les transforme en Restes de Désespoir. Dans ses derniers moments, Chiaki tente de rappeler à Izuru la personne qu'il était avant de mourir, ce qui amène Izuru à verser des larmes pour la première fois depuis sa transformation.