Durante una misión de entrenamiento en el Cortex, el Megapod se equivoca y Jeremy se ve obligado a descubrir cómo repararlo. Justo cuando lo hace, el superscaner encuentra una torre activada en el Cortex. Pero cuando llegan al sitio, encuentran que la torre tiene un halo púrpura. Ha sido activado por Tyron, y los Guerreros Lyoko pronto están rodeados de Ninjas.
