Um das Chaos an den Kohlenstoffmärkten zu beseitigen, will die japanische Regierung in Zusammenarbeit mit Ishida Finance Orochi erledigen. Dafür haben sie sich einen gewagten Plan ausgedacht. Unterdessen wird Kusanagi für den Verlust des kostbaren Prototyps zur Rechenschaft gezogen. Er wird zu Mikuni geschickt, um sich dort ihrer Prüfung zu unterziehen.